לצד ככר סן גאטנו, נמצאת נאפולי התת קרקעית שהיא חוויה יוצאת דופן למבקרים בעיר. לאחר ירידה ב 138 המדרגות אל מתחת לאדמה, מתגלה רשת של מנהרות, מחצבות, ובריכות מים אשר שימשו את תושבי העיר בתקופות שונות, החל מהתקופה בה התיישבו בעיר היוונים, ועד להפגזות במלחמת העולם השנייה, אשר הבריחו אליהם את התושבים שחיפשו מחסה. ההליכה במנהרות, שחלקן צרות, ובריכות המים הצלולים לאורך הדרך, מהווים אטרקציה ייחודית. הסיור במנהרות הוא בלוויית מדריך.
